对雌激素受体阳性的绝经前乳腺癌患者，他莫西芬是辅助内分泌治疗的标准方法。抑制卵巢功能是另外一种内分泌治疗的手段。2005年早期乳腺癌试验协作组的荟萃分析结果显示，单独抑制卵巢功能进行辅助内分泌治疗可以显著降低复发率、死亡率。但尚无直接研究数据显示抑制卵巢功能的疗效优于他莫西芬。
可逆的抑制卵巢功能方法包括药物治疗和放疗。前者是指促黄体生成素释放激素激动剂的使用，即戈舍瑞林、洛瑞林、亮丙瑞林等。疗效与患者体重密切相关，并且每月1次的给药频率并不一定会使所有患者的卵巢功能得到抑制。
单次放射剂量450 cGy或5-6次累计放射剂量1000-2000cGy也可抑制卵巢功能，但效果并不令人满意并且无法预知卵巢功能何时会恢复。此外，化疗虽然也可以抑制卵巢功能，但无法掌握效果以及可逆性。卵巢切除术是最根本的剥夺卵巢功能的方法。
对雌激素受体阳性的绝经前乳腺癌患者，单独抑制卵巢功能或卵巢功能抑制剂与他莫西芬联用，与化疗（多为环磷酰胺/甲氨蝶呤/5 - 氟尿嘧啶方案）疗效相当。
尽管最近有证据支持他莫西芬的辅助内分泌治疗延长至10年，但现在仍不清楚卵巢功能抑制联合或二者单独使用的最佳治疗持续时间。对年龄小于等于四十岁的女性患者，由于其体内雌激素水平较高，卵巢功能抑制的治疗效果最好。
芳香化酶抑制剂主要用于绝经后乳腺癌患者的内分泌治疗。由于芳香化酶抑制剂的负反馈调节作用会导致下丘脑不断刺激卵巢产生雌激素，绝经前乳腺癌患者禁用此类药物。但在通过卵巢功能抑制达到闭经的绝经前乳腺癌患者中存在一个问题，即芳香化酶抑制剂是否与他莫西芬疗效相同。
卵巢功能抑制联合阿那曲唑与卵巢功能抑制联合他莫西芬或他莫西芬单药治疗的疗效相比，结果尚不清楚。今年，卵巢功能抑制试验（SOFT）、他莫西芬与依西美坦试验（TEXT）的初步结果会告诉我们答案。
目前与内分泌治疗相关的临床试验依然存在很多不足。首先，化疗方案多为环磷酰胺/甲氨蝶呤/5 - 氟尿嘧啶，并没有反映出目前临床上广泛应用的以紫衫类和蒽环类为基础的化疗方案与内分泌治疗相比较的结果。第二，他莫西芬均在试验组，没有在对照组。第三，雌激素受体阳性的肿瘤异质性较大。之前开展的临床试验据没有使用基因组工具对雌激素受体阳性的肿瘤进行亚种分析。但是，由于不同亚种对雌激素治疗的敏感性可能不同，因此亚种分析可以优化内分泌治疗。
