APOBEC3基因缺失增加乳腺癌发病风险
全基因组关联研究（GWASs）确定了多个乳腺癌遗传易感基因位点。目前很少有研究评估拷贝数变异（CNV）情况、其他重要的基因变异情况与乳腺癌发病风险之间的联系。来自美国纳什维尔Vanderbilt大学医学院的Jirong Long等针对上述问题进行了相关研究，他们的研究结果发表在JNCI 2月最新的在线期刊上。
研究分为两个阶段。在2623名乳腺癌患者和1946名对照组患者中，研究者采用Affymetrix SNP Array 6.0进行了CNV GWAS研究（第一阶段）。然后他们在另一个独立的由4254名患者人群和4387名对照人群入组的研究中，采用实时定量聚合酶链反应（qPCR）对最可能存在的CNV进行扩增（第二阶段）。所有的受试者数据都来自于在上海女性中进行的基于人口的相关研究。
在第一阶段调查的268个常见CNVs（最小等位基因频率≥5%）中，研究者发现最强的联系存在于APOBEC3基因的广泛缺失，所以在第二阶段研究者们扩增了上述基因（优势比1.35，95%可信区间 1.27至1.44）。应用qPCR对两个阶段的所有样本进行分析，结果提示一个拷贝缺失的优势比为1.31（95%可信区间 1.21至1.42），两个拷贝缺失的优势比为1.76（95%可信区间 1.57至1.97）。
本研究结果以令人信服的证据提示APOBEC3基因序列中存在与乳腺癌发病相关的一个新的位点。至今为止，对于乳腺癌的发病风险而言，CNV是可确定的相关度最大的遗传风险变量。
