新的肿瘤早期诊断biomarker

2011-09-21 00:00 来源:欧易生物 作者:
字体大小
- | +

MicroRNAs(miRNAs)是一类进化上高度保守的单链RNA,通常长度在22nt左右。胞浆中成熟的miRNA与多种蛋白共同形成miRNA诱导的沉默复合体(miRNA-induced silencing complex, miRICS)结合于靶mRNA的3'-UTR区域,阻遏翻译甚至直接降解mRNA,抑制基因表达。在肿瘤发生和发展中,miRNA表达谱发生改变,抑制肿瘤的miRNAs(tumor suppressor miRNA,TSmiRs)减少,而促进肿瘤的miRNA(oncogenic miRNAs,oncomiRs)过表达。不同的肿瘤 miRNA表达谱并不相同,在特定肿瘤细胞中,特定的miRNA上调或下调。早在2002年,Calin GA等发现多数慢性淋巴细胞白血病患者miR-15a和-16a缺失或下调。2003年,Micheal MZ等分析了结肠癌和正常粘膜中28种miRNA的表达情况,发现肿瘤组织中miRNA-143和145显著低于正常组织。之后关于肿瘤组织miRNA表达谱、肿瘤组织和正常组织差异miRNA以及这些miRNA与肿瘤发生、发展和疗效、预后判断等的研究日益增多,也取得了非常有意义的进展。例如2008年Rosenfeld等发表于Nature Biotechnology的文章报道了基于253例不同肿瘤样本的48种miRNA profile结果,根据上述结果对转移灶进行的双盲验证显示,基于miRNA的未知来源转移灶分类的准确性超过了90%!显示miRNA在肿瘤诊断中的巨大应用前景。

目前,肿瘤早期诊断、特别是非侵袭性的肿瘤早期诊断日益受到关注。通过检测血液中的核酸或蛋白,对易感人群进行早期筛查成为目前肿瘤诊断研究的一个热点。同时,通过非侵袭的方法亦有助于进行肿瘤分型、进行个体化治疗并实时跟踪肿瘤治疗效果,判断预后等。作为抗肿瘤研究中的新秀,miRNA在其中的作用日益受到重视。

miRNA的变化是肿瘤发生的早期事件。Pre-microRNA运送到胞浆之后,大部分被Dicer剪切生成成熟的miRNA,行使生物学功能。少部分Pre-miRNA则被多囊体( multivesicular body,MVB)包裹,最终以外排颗粒的形式转运出细胞,进入循环系统。另一种途径是通过与RNA-binding 蛋白(例如nucleophosmin 1,NPM1)等的结合形成核酸-蛋白复合体,pre-miRNA被转运出胞浆进入循环系统,研究显示:血液中90%的miRNA是以核酸-蛋白复合物形式存在的。

作为潜在的biomarker,miRNA具有蛋白marker无法比拟的优势。miRNA稳定性非常好,我们实际工作经验证明,一些“恶劣”条件下,样本mRNA大量降解,但miRNA基本保持完好。例如,较长储藏时间、石蜡标本等。(当然,保存良好的新鲜样本更加理想,也便于进行miRNA与mRNA整合分析)。文献报道认为体液样本(例如血浆中的miRNA)的miRNA的稳定性源于其在血液中以核酸-蛋白复合物形式存在或包被于外排颗粒当中,使miRNA耐受包括反复冻融、较高或较低pH等情况,不易被降解。因此,通过检测血液(以及其它体液)中的miRNA进行肿瘤早期诊断、预后判断以及药物选择、疗效检测等非常可行。表1列举了可能作为biomarker的肿瘤患者血液中特异的miRNA。

目前检测血液中miRNA的技术包括miRNA芯片(高通量)和qPCR等。针对特定miRNA的检测以q-PCR为主。目前,欧易技术平台提供miRNA芯片检测-生物信息学分析-荧光定量PCR验证“一条龙”的差异miRNA筛选和检测技术服务。欧易公司在多年的技术服务中,针对不同样本(包括新鲜组织、细胞样本、冰冻样本以及石蜡标本等)的处理积累了丰富经验;同时,欧易生物还拥有自主知识产权的miRNA引物库,提供针对人,大鼠,小鼠,一千多条经反复验证过的引物,供客户自由选择;针对客户不同需求,我们采用加尾法以及茎环法两种不同实验原理,为您的芯片实验结果提供定量PCR验证,您可根据实验需要自由选择。您只需要提供保存完好的组织(包括石蜡包埋的组织)、细胞、血液、血浆或血清等标本,我们即可针对您提供的miRNA设计探针,进行实时定量PCR实验,最终提供给您完整规范的实验报告,节约您的时间和精力。

关于欧易生物更多详情,请登录欧易公司网站http://www.oebiotech.com

表1 血液中肿瘤biomarker及其临床疾病相关性

编辑: 莉莉

版权声明

本网站所有注明“来源:丁香园”的文字、图片和音视频资料,版权均属于丁香园所有,非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明“来源:丁香园”。本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。同时转载内容不代表本站立场。