ASCO2014：刘学文医生等通过综合基因组分析探索肺肉瘤样癌治疗靶点
肺肉瘤样癌是一种罕见的、高度侵袭性肺部肿瘤，预后差，传统化疗效果欠佳，患者预后差。人们对其独特的双向分化模式分子基础了解不多。
中山大学华南肿瘤学国家重点实验室刘学文医生等使用微阵列单核苷酸多态技术（SNP array）和高通量测序技术来识别新型分子治疗靶点，提供基于肺肉瘤样癌分子发病机制的新治疗策略。
研究选取了肺肉瘤样癌患者新鲜冰冻肿瘤组织和配对的正常组织上提取的10对基因组DNA样本。全基因组外显子测序在哥伦比亚基因组中心操作，肿瘤组织样本的测序深度中位值为120x，正常组织为60x。由IlluminaTruSeq panel对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的肿瘤组织DNA进行确认。
通过对这10个患者的DNA样本和另外一个肺肉瘤样癌队列的18份FFPE肿瘤组织提取的DNA样本进行Sanger测序，然后选择10个排名第一的基因进行确认。把分离的DNA杂交到Affymetrix SNP 6.0 arrays芯片上，然后与来自两个队列的对照组的689名肺腺癌患者对比。
结果显示，全基因组外显子测序检测到TP53（70%）、KRAS（20%）和PIK3CA（20%）基因突变，通过TruSeqIllumina panel分别进行确认。
10个基因中有8个排在排行榜的顶端，包括RASA1(20%)，RYR2 (20%), CDH4 (20%), CDH7 (20%), LAMB4 (30%), MET (20%), SCAF1 (20%), and LMTK2 (20%)，使用Sanger测序法对它们进行确认。正在对该队列的18份从FFPE肿瘤组织提取的DNA样本进行确认，且将对新的可操作的靶点进行功能确认。
微阵列单核苷酸多态技术能从腺癌标本中清晰地辨认出肉瘤样癌标本，后者染色体3q,7, 8q, 11p, 11q and 17q拷贝数明显增加。
研究表明，高通量测序技术和微阵列单核苷酸多态技术可确认肺肉瘤样癌中新分子事件，可能为肺肉瘤样癌提供新的治疗策略。