2014年8月24日 国际顶级学术期刊《自然•遗传学》（Nature Genetics）在线发表了中国医学科学院肿瘤医院赫捷院士领衔、北京泛生子生物科技有限公司参与的中国食管鳞癌基因组学研究的最新成果。该研究论文报道了迄今最大规模的食管鳞癌外显子组测序研究，重点阐释了组蛋白修饰和Hippo 信号通路相关基因的突变与临床意义。论文题目为“Genetic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma”。
课题组利用全外显子组测序分析技术，对113例肿瘤和正常组织配对样本以及8株细胞系的基因突变谱进行了全景式的研究。该论文首次以详实的数据展示了食管鳞癌半数以上具有组蛋白修饰酶等表观遗传基因的突变，其中EP300 基因的突变集中于该蛋白的乙酰基转移酶活性域，并与患者预后不良显著相关。
课题组进而在多中心队列中验证了这一关联，并通过体外实验证明了EP300 突变对食管鳞癌细胞增殖具有促进作用。研究还发现，Hippo信号通路的异常改变是食管鳞癌的又一重要特征，其中AJUBA 基因的高频突变为首次报道。其他重要基因，如NOTCH1、RB1、CCND1、MIR548K 等的突变也与患者的发病或预后显著相关，具有潜在的诊断、分型和治疗应用价值。
上述发现为食管鳞癌病因与发病机理的研究、分子分型及个体化治疗方案的探索提供了理论和实验依据。
这是继6月 《自然•遗传学Nature Genetics》发表泛生子关于脑干胶质瘤的科研成果后，泛生子正式运营近一年来，合作科研成果第二次被《自然•遗传学Nature Genetics》期刊发表。
出版于英国的《自然•遗传学》是遗传学领域最权威的期刊之一，其SCI（科学引文索引）影响因子高达35.5。据亚洲自然杂志网（NatureAsia）公布的数据显示：2013年全年，中国仅有29篇论文发表于此期刊中。
有效开发中国特有的医疗资源，创造更大的社会价值，是泛生子团队与国内临床及科研工作者共同的愿望。因此泛生子将世界水平的癌症基因组分析技术带到中国，确保不同癌症种类的基因组均可以得到高水平的分析，为个体化诊断治疗提供依据。
泛生子首席科学家阎海教授认为：洞悉癌症背后的遗传学改变，能够从分子水平揭示肿瘤产生的根源和它赖以生存的关键机制，从而可以突破癌种的界限，为临床治疗提供最多样化、最符合每个患者独特需要的选择。在此次和医科院肿瘤医院的合作中，研究人员就发现食管鳞癌的基因突变谱与其他组织起源的鳞状细胞癌十分相似，提示在不同部位的癌症可能具有相似的分子起源，因此基于分子分型的个体化治疗是未来癌症治疗的发展方向。
泛生子首席执行官王思振表示：“本篇文章中泛生子提供的全外显子分析只是我们所应用的癌症基因组学技术之一。泛生子还将不断优化创新其他世界领先的技术，并进一步规模化、流水线化，以更好的适应中国市场。”泛生子目前所参与的研究项目涵盖包括肺癌、肝癌、胃癌、食管癌、脑癌等在内中国最高发的几大癌症。
泛生子在癌症的全周期健康管理中，将扮演重要角色，为中国癌症患者提供最优质的服务：从助力中国高发癌症的基础研究、填补更多国际空白，到将独有研发技术进行产业化，提供临床可用的创新型检测产品；从建立科研与临床之间的重要桥梁，到帮助医生和患者寻找最佳治疗方案。泛生子以技术创新与高品质服务为着眼点，形成独特的商业模式，领导中国癌症个体化医疗的发展潮流。
论文摘要：
在该项研究中，科研人员利用全外显子组测序技术，对113例食管鳞癌患者的肿瘤和对照组织配对标本，以及8株细胞系的基因突变谱进行了全景式研究，发现平均每个肿瘤的基因组外显子区域有82个非同义突变。研究发现，食管鳞癌的突变谱与其他组织来源的鳞状细胞癌类似，而与食管腺癌大相径庭。
几乎全部（99%）食管鳞癌中都可以观察到细胞周期以及凋亡调控相关基因的突变，包括体细胞改变，如TP53（93%）、CCND1（30%）、CDKN2A（20%）、NFE2L2（10%）以及RB1（9%）等；
此外还可以观察到组蛋白修饰基因的高频突变，包括KMT2D（又名MLL2，19%）、KMT2C（MLL3，6%）、KDM6A（7%）、EP300（10%）以及CREBBP（6%），其中组蛋白乙酰基转移酶EP300突变与不良预后显著相关；当FAT1，FAT2、FAT3或FAT4（27%）、或 AJUBA（JUB，7%）发生突变时，会导致Hippo通路失调；而 NOTCH1、NOTCH2 或 NOTCH3（22%）、或 FBXW7（5%）发生突变时，会导致Notch通路失调。
上述研究结果证实了表观遗传学改变对食管鳞癌预后的影响，并为潜在治疗方案的开发和使用提供理论与实验依据。
