高敏 ddPCR 检测 T790M 突变媲美 NGS,阳性率更高

2020-07-16 10:53 来源:丁香园 作者:
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研究背景:EGFR T790M 突变是一代/二代 EGFR-TKI 治疗失败后的主要耐药突变,目前第三代 EGFR-TKI 奥希替尼对这类患者有很好的疗效,因此,早期检测 T790M 突变就显得尤为重要。但检测 T790M 突变还有很多挑战:对于活检样本,由于治疗后的肿瘤组织纤维化和大量非肿瘤性间质组织,导致肿瘤分数低,T790M 检测难度大;对于细胞学样本,如胸腔积液样本,由于存在大量非肿瘤细胞,如巨噬细胞、间皮细胞和淋巴细胞,导致肿瘤分数低,T790M 检测难度大;基于以上种种,尤其当组织样本不足或无法取得时,抽提患者的血浆 ctDNA 进行液体活检就变得越来越普遍,但普通液体活检的灵敏度相对较低,这可能与肿瘤负荷低以及 ctDNA 的抽提效率低有关。而 NGS 亦由于灵敏度较低(5%-10%)以及价格高、检测周期长等原因,并不能很好地满足临床上对于 T790M 检测的需要。左右为难之际,高敏数字液滴 PCR(ddPCR),进入了大家的视野。

研究目的:本研究旨在评估使用高敏 ddPCR 检测不同细胞学样本 T790M 突变的阳性率、灵敏度和特异度。

研究设计:本研究共收集到 42 份来自 36 名患者的细胞学样本,使用 PicoPure DNA extraction kit 和 Agentcourt AMPure XP kit 抽提 10ng DNA,使用 QX100 Droplet Digital PCR System 检测 T790M 突变状态。

研究结果:使用 ddPCR 成功对 36 份样本(36/42,86%)进行了 EGFR T790M 突变状态的检测,其中还包括肿瘤分数 ≤ 20% 的样本。与 sanger 法或 NGS 相比,总体的灵敏度 = 93%,特异度 = 96%。使用 ddPCR 检测 EGFR-T790M 突变阳性率为 40.5%(17/42),使用 sanger 法或 NGS 检测 EGFR-T790M 突变阳性率为 35.7%。

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细胞学样本包括:胸腔积液样本 13 份、淋巴结细针穿刺样本 10 份、肺细针穿刺样本 8 份,软组织细针穿刺样本 6 份、支气管肺泡灌洗样本 2 份,肾细针穿刺样本 1 份、甲状腺肺细针穿刺样本 1 份、支气管刷检样本 1 份。

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灵敏度 = 93%,特异度 = 96%;

研究结论:本研究提示,高敏 ddPCR 检测 EGFR T790M 突变状态灵敏度和特异度高,在细胞学样本,包括肿瘤分数低的样本中使用,可靠性高。

文章出处:Arch Pathol Lab Med. 2020 Jan 6. doi: 10.5858/arpa.2019-0411-OA. [Epub ahead of print]



校对/审稿专家  

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陈骏   肿瘤学博士

大连医科大学附属第二医院

教授 主任医师 博士研究生导师

美国 MayoClinic(梅奥医院) 高级访问学者

澳大利亚 Universityof Western Australia(西澳大学) 高级访问学者

国际癌症支持治疗学会 (MASCC) 会员

国际肺癌研究协会 (IASLC) 会员

中国研究型医院学会分子肿瘤与免疫治疗专业委员会副主任委员

中国医师协会医学科普分会肿瘤科普专业委员会副主任委员

中国肺癌防治联盟液体活检专业委员会副主任委员

中国老年学和老年医学学会精准医疗分会常务委员

中国抗癌协会肿瘤临床化疗专业委员会委员

辽宁省抗癌协会肿瘤靶向治疗专业委员会副主任委员

辽宁省抗癌协会肺癌专业委员会副主任委员

辽宁省免疫学会肿瘤学分会副主任委员

中国微生态学杂志、中国医药科学杂志编委, 中国肺癌杂志、Journal of Thoracic Oncology、European Journal of Cancer、Plos One、Journalof Cancer Research and Clinical Oncology 等杂志审稿专家

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赵明芳   肿瘤内科副主任

中国医科大学附属第一医院

主任医师 教授 博士研究生导师

中华医学会肿瘤学分会肺癌学组委员

中国抗癌协会肺癌专业委员会委员及内科学组委员

广东省临床试验协会 (GACT/CTONG) 理事

CSCO 非小细胞肺癌专家委员会委员

中国研究型医院学会分子诊断专业委员会肺癌学组副组长

中国医药教育协会肺部肿瘤专业委员会常委

中国研究型医院学会精准医学与肿瘤 MDT 专委会委员

中国研究型医院学会生物治疗学专业委员会委员

中国老年学和老年医学学会肿瘤康复分会委员

中国医疗保健国际交流促进会胸部肿瘤分会委员

辽宁省抗癌协会靶向治疗专业委员会副主任委员

(排名不分先后,按照姓名首字母顺序排序)


以上内容仅供医学专业人士参考。

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编辑: 冯依璠

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