西安交通大学医学院第二附属医院(710004)
南岩东 杨拴盈 田应选 张 潍 周 斌 卜丽娜 霍树芬
评价应用激光捕获显微切割(LCM)联合高效液相色谱(HPLC)、电喷雾(ESI)-离子阱串联质谱(ITTMS)技术分离、鉴定肺腺癌组织细胞表达蛋白质谱的方法,探讨肿瘤特异性蛋白在肺腺癌发病机制、早期诊断和鉴别诊断方面的价值。应用LCM 技术分离纯化6 例肺腺癌细胞,经细胞裂解、总蛋白提取及胰蛋白酶酶解后,对混合蛋白质的酶解肽段应用HPLC、ESI-ITTMS 获得其氨基酸序列;原始数据经BioworksTM 软件搜索IPI 人类蛋白数据库,鉴定肺腺癌细胞表达蛋白质谱;进一步利用GO 工具对所鉴定的蛋白质分别从细胞组件、分子功能、生物学途径等方面进行分析。应用LCM 技术成功地从肺腺癌组织中分离出感兴趣的细胞,其同质性>95%;通过HPLC、ESI- ITTMS 获得混合蛋白质的酶解肽段总离子流图、一级质谱图及二级质谱图;经数据库查询,鉴定出843 个蛋白质群(2023个蛋白质);分别对这些蛋白质及其酶解肽段的生物学属性(包括氨基酸序列、覆盖率、分子量、等电点等)进行了分析,并应用GO 工具明确所鉴定蛋白质功能。提示LCM 技术能够成功的分离感兴趣的细胞,较好的解决了肺癌组织异质性的问题;HPLC、ESI- ITTMS 可高通量、全景式、大规模地分离、鉴定肿瘤细胞表达蛋白质,从整体的角度研究肿瘤的发病机制。