研究要点
- 研究者发现，突变-等位基因肿瘤异质性作为生物标志物联合患者HPV状态可提供可靠的生存预后信息；
- 研究者的工作验证了以下结论：手术时患者肿瘤突变-等位基因异质性比值高是生存转归差的预后因子。
- HPV阳性头颈鳞状细胞癌患者的平均突变-等位肿瘤异质性比值比HPV阴性患者低。
利用下一代测序技术和头颈鳞状细胞癌患者的临床数据，研究者发现突变-等位肿瘤异质性值作为生物标志物结合患者的人类乳头状瘤病毒(HPV)状态可作为患者生存的可靠预后因子。Rocco等人在2014年头颈癌多学科研讨会上报道了上述结论。
研究者分析了下一代外显子组测序数据并将其与通过癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)获得的若干研究院认可有效的临床患者数据进行结合分析。TCGA数据包含了305例头颈鳞状细胞癌患者的信息；其中有35例患者为HPV阳性。研究者通过计算突变-等位肿瘤异质性值，即肿瘤特异性突变-等位分布分数比值评估了每一个肿瘤样本的遗传学异质性。
研究者仅对突变-等位基因分数值不少于0.075的数据进行分析，并将高突变-等位肿瘤异质性阈值确定为32，既往研究中发现这一数值可作为区分转归类型的标准。研究者进行了 Cox 比例风险分析以评估突变-等位肿瘤异质性比值及HPV与患者总生存的关系。
研究发现
研究者的工作验证了患者手术时高肿瘤突变-等位肿瘤异质性是转归差的预后因子，HPV阳性头颈鳞状细胞癌患者的平均突变-等位肿瘤异质性值比HPV阴性患者低。
在双变量分析中发现，突变-等位肿瘤异质性比值及HPV均与生存显著相关。按HPV状态进行分层后分析发现，突变-等位肿瘤异质性与临床患者亚组的转归呈相似的相关性，而与患者临床特征，包括肿瘤边缘、淋巴结分型、或肿瘤分期等无关。173例幸存者的中位随访期为22个月。
研究者表示，值得注意的是突变-等位肿瘤异质性比值是一种持续变量，研究者使用了一个确定值来建立COX曲线，但实际上完全可能通过微调来预测患者的转归。在TCGA数据集中，研究者获得了四倍于既往研究的受试者数据，因此可建立基于HPV状态分层的突变-等位肿瘤异质性比值。
上述发现为HPV阳性头颈鳞状细胞癌患者的个体化治疗提供了契机，并且也有助于甄别更可能从临床试验中获益的患者。研究作为报道无相关利益冲突。
