Heikki Joensuu及其同事在胃肠道间质瘤(GIST)研讨会上称，直径大于2 cm 的GISTs应予摘除，这一陈述是基于2011年国家综合癌症网(NCCN)GIST临床实践指南作出的。在2013年的修订版本中，NCCN提供了关于胃和小肠GISTs恶性化程度和风险评估指南，但未对所有直径大于2cm的可摘除GISTs作出推荐。
起源于小肠或直肠的GISTs恶性化程度较胃GISTs更高。举例而言，如果在50个高倍视野中发现细胞分裂速度大于5个，那么小肠GISTs(<2 cm)出现疾病进展的风险约为54%。极小十二指肠GIST (<1 cm)因出血风险和恶性化程度高而可考虑进行手术切除。因此小肠和直肠小GIST 应予切除或谨慎随访观察。考虑到直径为2—5 cm的细胞分裂指数较低的胃GISTs的疾病进展风险低(3·6%)，而高细胞分裂指数的胃胃GISTs的疾病进展风险为中度，对于选择性无症状、无高风险超声特征的胃GISTs可安全随访至肿瘤直径超过3cm。小GISTs的手术治疗应根据肿瘤大小做出决策。
