背景:III 期GRID研究显示REG治疗至少经伊马替尼(IM)和舒尼替尼治疗失败的晚期胃肠道间质瘤(GIST) 相较于安慰剂可显著性改善患者无进展生存期(PFS) (SU; HR 0.27, p<0.0001)。由于肿瘤生长的异质性,明确TKI难治性GIST基因型是一项具有挑战性的任务,而且患者对连续接受一系列的活检也表现出抵触。为克服上述难题,研究者以血浆游离DNA为样本分析肿瘤DNA,并对其突变状态与临床结局之间的关联进行了研究探讨。
方法:研究者分别应用Sanger测序法和BEAMing法对存档组织样本DNA (n=102)和血浆DNA(n=163)进行突变分析。
结果:肿瘤组织样本相关基因的突变频道为:KIT, 66%; PDGFRA, 3%; KRAS, 1%; BRAF, 0%。血浆样本的突变频率为:KIT, 58%; PDGFRA, 1%; KRAS, 50%, BRAF, 0%。主要KIT突变在组织和血浆样本中检出的一致率为84%;次要KIT突变在血浆中的检出率(47%)高于组织样本(12%)。对于成像研究的中心和局部回顾的全部亚组中,基于突变位点的亚组分析显示,与安慰剂组相比,REG治疗组可改善PFS。在安慰剂治疗组,血浆检出的次要KIT突变与PFS减少相关(HR 1.82, p=0.05)。KIT外显子9突变的人群中,接受短期伊马替尼治疗和接受长期舒尼替尼治疗的患者与其他GIST基因型相关。PDGFRA突变患者显示出多样化的临床答应局面,1/1 KRAS突变的GIST患者对伊马替尼、舒尼替尼或REG反应均不佳。
结论:KIT基因突变状态与伊马替尼和舒尼替尼治疗时间相关。与既往组织样本研究报道结果相一致,本研究验证了基于血浆游离DNA分析目标癌基因方法的有效性。次要KIT突变似对GIST产生阴性的预后影响,REG治疗与安慰剂相较其临床获益不受KIT基因突变状态的影响。临床试验信息:NCT01271712。