直肠癌细胞系BRAF V600E测序结果对比
对于食管鳞状细胞癌(ESCC)的分子靶向治疗，表皮生长因子受体(EGFR)是一种极有发展前景的靶点。因此，在确定治疗方案过程时，对KRAS与BRAF突变进行的分子诊断具有重要的临床意义。然而，由于以往研究相关样本规模均很有限(N ≤ 80)，因此，目前仍尚不明确食管鳞状细胞癌KRAS与BRAF的突变发生频率。为此，美国外科医生学会会员、日本熊本大学的Hideo Baba博士等人通过焦磷酸测序法进行了专项研究，焦磷酸测序法作为一种非电泳式核苷酸延伸测序技术，可用于突变检测方面，该研究结果发表于2012年12月30日在线出版的《外科肿瘤学年鉴》(Annals of Surgical Oncology)杂志上。
研究过程中，研究人员通过一个包括203例经手术切除的食管鳞状细胞癌患者非偏倚性数据库以及高通量焦磷酸测序分析，对KRAS与BRAF突变频率进行了考察。
研究人员首先通过检测全部4类直肠癌组织KRAS突变样本的方式，证实了对KRAS进行焦磷酸测序方法的正确性[c.35G>T (密码子12 GGT>GTT), c.35G>A (密码子12 GGT>GAT), c.34G>T (密码子12 GGT>TGT), c.38G>A 突变 (密码子13 GGC>GAC)]，在此之前，已通过Scorpion-ARMS (蝎形探针扩增阻滞突变系统，Scorpion Amplified Refractory Mutation System)技术对这9种直肠癌组织样本进行了诊断(9/9; 100 %)。同时，对3种直肠癌细胞系BRAF突变状态进行的检测也获得了相似结果，并且，通过桑格双脱氧测序法也证实了这些结果的正确性。随后的发现表明，在包含203例食管鳞状细胞癌患者的数据集中，KRAS突变极为罕见(203例患者中仅1例; 0.5 %)，而且也不存在BRAF突变(203例患者中有0例; 0 %)。
该项研究结果表明，KRAS与BRAF突变在食管鳞状细胞癌发展过程中作用有限，并且对于食管鳞状细胞癌进行的突变分析，也不具有在与抗EGFR治疗时进行敏感性筛查一样的应用价值。
