患者组和对照组甲基化情况
致癌性人类乳头状瘤病毒的持续感染是形成宫颈癌形成的必要原因之一。本研究的作者最近证实与暂时性感染中相比，HPV16基因组在宫颈癌癌前病变者中甲基化更显著。然而，在其他HPV分型中甲基化的程度以及甲基化对于癌症进展的作用目前还知之甚少。Nicolas Wentzensen等针对上述问题进行研究，其研究结果发表在Radiother Oncol 10月的期刊上。
研究者在三种最常见的致癌性HPV基因型中进行全基因组甲基化模式分析，包括与HPV16最相似的HPV31，以及其他两种相关的类型HPV18和HPV45。从92名具有宫颈癌癌前病变的女性中采集宫颈细胞学标本进行DNA提取，同时也从96名感染了HPV31、HPV18或HPV45病毒但未出现细胞学或组织学异常的女性中采集宫颈细胞学标本提取DNA。在进行了亚硫酸氢钠修饰后，对覆盖了80-106个位点的基因进行全基因组焦磷酸化测序。研究者计算了不同位点间中位甲基化、比值比、曲线下面积、Spearman排序甲基化相关系数水平分析。所有的统计检验皆为双侧。
对三种HPV基因型而言，与间断感染的患者而言，研究者发现在宫颈上皮内瘤样病变3级女性中E2、L2和L1区域中多个CpG位点甲基化水平增高。研究者同时也观察到了甲基化形式与感染HPV种类之间的联系。HPV 31曲线下面积最大值为0.81、HPV 18为0.85、HPV 45为0.98。多发感染的宫颈上皮内瘤样病变3级患者的不同甲基化形式提示甲基化能确定感染的种类。
致癌性HPV DNA甲基化提示HPV感染的转化。本研究的结果指出致癌性HPV甲基化类型有提示诊断的意义。
