3例典型成神经细胞瘤肿瘤样本中的端粒分析
神经母细胞瘤在从出生至早期成年的广泛时间段内均可广泛发生,为了探索神经母细胞瘤患者遗传突变与诊断时的年龄的关系,美国发育神经生物学实验室Nai-Kong V. Cheung博士等人对1987年至2009年的40名转移成神经细胞瘤患者的肿瘤组织及匹配细胞系进行DNA水平遗传测序工作,相关研究成果发表在国际权威杂志JAMA2012年3月14日在线版上。
这一研究中诊断年龄队列分为婴儿组(<18月),儿童(18月至<12岁)组,青春期及低龄成年人(≥12岁)组。为了证实这一队列研究的发现,1985年至2009年间得到的另外64例患者的肿瘤组织也被用来测序,福尔马林固定,石蜡包埋的肿瘤组织被用于免疫组化分析及原位荧光杂交。整基因组遗传测序数据,定量PCR技术以及原位荧光杂交技术被用于端粒长度的分析工作。
这一试验旨在探索成神经细胞瘤患者肿瘤组织频发的突变与诊断时的年龄及端粒长度的关系。结果显示,在发现队列中(n = 40),青春期及低龄成人组的5名患者100% (95% CI, 50%-100%)检测出伴地中海贫血连锁智力低下综合征(ATRX)基因存在突变,儿童组(5 of 29)患者肿瘤组织中有17% (95% CI, 7%-36%)发现该基因突变,而婴儿组(0 of 6)肿瘤组织中该基因的突变率则为0% (95% CI, 0%-40%)。在确认队列中(n = 64),青春期及低龄成人组(9 of 27)患者肿瘤组织中有33% (95% CI, 17%-54%)发现ATRX基因的突变,儿童组(4 of 25)肿瘤组织有16% (95% CI, 6%-35%),婴儿组(0 of 12)肿瘤组织中有0% (95% CI, 0%-24%)发现ATRX基因的突变。在两个队列的所有样本中(N = 104),青春期及低龄成人组(14 of 32)有44% (95% CI, 28%-62%)的肿瘤组织发现ATRX基因的突变,而儿童组(9 of 54)肿瘤组织和婴儿组(0 of 18)肿瘤组织中这一数据分别为17% (95% CI, 9%-29%)和0% (95% CI, 0%-17%)。
结论:儿童和低龄成人4期成神经细胞瘤患者中ATRX基因突变与诊断时的年龄呈现相关性。
文献下载:Association of Age at Diagnosis and Genetic Mutations in Patients With Neuroblastoma