结直肠癌是美国癌症患者的第二大死因,是欧洲癌症患者的第三大死因。深入了解结直肠癌发病的遗传学基础,将有助于我们掌握肿瘤的临床进展行为和药物响应性。西班牙的 Puerta 教授以综述形式介绍了结直肠癌诊断和预后相关的遗传学标志物,文章于 2015 年 8 月 3 日在线发表在 Pharmacogenomics 上。
下面本文将主要从基因组不稳定性(微卫星和染色体不稳定性)、CpG 岛甲基化表型、微小核糖核酸(microRNA)、组蛋白修饰、蛋白质生物标记物、基因突变(RAS、BRAF、PI3K、TP53、PTEN)和多态性(APC、CTNNB1、DCC)等方面介绍结直肠癌的遗传学变化。
结直肠癌的TNM分级系统
1. 原发性肿瘤(T)
Tx 原发性肿瘤无法评估
T0 没有证据表明原发性肿瘤
Tis 原位癌: 肿瘤在上皮内或侵入固有层
T1 肿瘤浸润黏膜下层
T2 肿瘤浸润肌层固有层
T3 肿瘤透过固有肌层侵入结肠或直肠周围的组织
T4a 肿瘤穿透内脏腹膜表面
T4b 肿瘤直接浸润或附着其他器官或结构
2. 局部淋巴结(N)
Nx 局部淋巴结无法评估
N0 无局部淋巴结转移
N1 存在 1-3 个局部淋巴结转移
N1a 存在 1 个局部淋巴结转移
N1b 存在 2-3 个局部淋巴结转移
N1c 肿瘤在浆膜下层、肠系膜或非腹膜、结肠周围或直肠周围组织种植转移,且无局部淋巴结转移
N2 存在 ≥ 4 个局部淋巴结转移
N2a 存在 4-6 个局部淋巴结转移
N2b 存在 ≥ 7 个局部淋巴结转移
3. 远处转移(M)
M0 没有远处转移
M1 远处转移
M1a 转移仅限于一个器官或位点(例如肝脏、肺脏、卵巢、非局部淋巴结)
M1b 转移多于一个器官/位点或到腹膜
结直肠癌的分子生物标志物
1. 基因组不稳定性
(1)接近 12-17% 的散发性结直肠癌病例存在微卫星不稳定性(MSI)。目前,微卫星不稳定性-高(MSI-H)已成为一个很好的结直肠癌患者总生存期预后指标。
(2)结直肠癌患者的染色体畸变发生频率为 50-85%。染色体不稳定性(CIN+)通常与结直肠癌患者的总生存期、无进展生存(PFS)缩短以及 5-氟尿嘧啶治疗后的不良预后相关。
2. CpG岛甲基化表型
接近 29.6% 的结直肠癌患者表现为 CpG 岛甲基化表型-高(CIMP-H)。然而,CpG 岛甲基化表型对结直肠癌患者的预后价值仍在研究中。
3. microRNAs
特异性 microRNAs 上调或下调主要与结直肠癌患者的总生存期和无进展生存期、转移、局部浸润、肿瘤体积、分期、治疗结果、复发和耐药性相关。
4. 组蛋白修饰
组蛋白修饰是一个很好的早期结直肠癌预后指标。
5. 基因突变
(1)APC 基因 p.D1822V 突变体含有 VV 纯合子提示结直肠癌的发病风险降低。
(2)根据 APC(rs565453 y rs1816769)和 CTNNB1(rs229303)基因多态性,可以对结直肠癌患者进行死亡风险分层。
(3)APC 基因 p.I1307K 突变体是德系犹太人结直肠癌发病的风险因素。
(4)DCC 基因 rs174 G-allele 突变体基因多态性是结直肠癌发病的风险因素。
(5)18q 染色体上的基因缺失(例如 SMAD4 和 DNAM-1)与结直肠癌患者的生存期缩短相关。
(6)TPX2(20q11)和 AURKA(20q13.2)蛋白质水平上调可以促使结直肠癌患者的 20q 扩增。
(7)TP53 基因的 p.R72P 多态性(C-allele)与结直肠癌发病风险升高相关。
(8)KRAS 基因(p.G12D、p.G12V 和 p.G13D)突变是结直肠癌最常见的突变,它与结直肠癌患者的预后不良、生存期缩短、短期复发和抗 EGFR 药物耐药相关。
(9)约 12% 结直肠癌存在 BRAF 突变,该突变与结直肠癌患者的总生存期缩短,以及 KRAS 野生型结直肠癌患者抗 EGFR 药物治疗后的无进展生存期缩短相关。
(10)PI3K 基因外显子 20 突变与结直肠癌患者的药物不响应、无进展生存期和总生存期缩短相关。
(11)22% 的结直肠癌患者存在 PTEN 基因缺失,该基因缺失与 EGFR 抑制剂不响应和患者死亡风险升高相关。
6. 蛋白质生物标记物
蛋白质分子学标志物的临床应用主要包括:早期诊断(hnRNP A1、kininogen-1、adipophilin、Apo AI 和 C9、OLFM4)、预后(SM3、desmin、surviving 和 hTERT、NM23)、潜在的治疗靶点(EB1)。